主要有以下两点区别：

　　1.审计决定书是审计机关对被审计单位直接进行的处理、处罚，按照《审计机关审计项目质量控制办法》第六十五条的规定执行；审计移送处理书是审计机关审计被审计单位后，不能直接进行处理，按照职责范围，应当交由其他部门纠正、处理、处罚或者追究有关责任人员行政责任、刑事责任而形成的一类审计文书，其按照《审计机关审计项目质量控制办法》第六十六条的规定执行。

　　2.审计决定书主要是对“事”的处理、处罚。即审计机关对被审计单位违反国家规定的财政收支、财务收支行为的处理、处罚，也包括审计机关直接对“人”的处罚，即依法对有关责任人员进行的审计罚款。而审计移送处理书既对“事”进行纠正、处理、处罚，也对“人”进行处罚，但主要是对“人”的处理。即审计机关出具审计移送处理书进行依法移送，由有权处理的机关追究有关责任人员的行政责任或刑事责任。