深圳市是全国首个创新型试点城市，多年来，福田区形成了以企业为主体的自主创新模式。一大批企业参与和实践自主创新，并转化为生产力，为我区的社会经济发展注入了新的活力。在市科技部门公布的100家具有代表性的自主创新企业中，我区占全市总数近三分之一，达31家。这些代表性企业通过战略创新、技术创新、经营模式创新、管理创新、文化创新以及大胆创新商业模式等进入业内最具竞争力、最具成长性的创新型企业,取得了丰硕成果。

　　31家自主创新代表性企业，涉及的行业包括微电子、计算机软硬件、通信、汽车电子、电子元器件、医疗器械、医药、光电子、新材料、新能源与环保、文化产业及传统产业等领域。

　　在医药领域，企业的自主创新尤显突出。深圳致君制药有限公司作为深圳一致药业的核心企业，经过多年发展，现位居中国制药工业50强。深圳万乐药业有限公司是中、日、港合资兴办，创立18年来以年均30%以上的速度成长。凭借在全国肿瘤生产企业综合排名第二的佳绩，成为行业的领导先企业。深圳信立泰药业股份有限公司，以开发国家一、二类新药为主，主攻心血管、抗过敏及感染等治疗领域。其产品被为认定为国家级重点新产品。深圳市康哲药业有限公司主要从事先导多肽化合物的研究与开发，在医疗器械领域，该公司摇篮有自主知识产权的产品多件。深圳市北科联药业科技有限公司是一家集中药新药研发、生产、销售、种植及动物实验于一体的高科技企业，开发20项国家级新药、取得国家专利注册23个，形成了产学研一体化的创新网络。